Z tej samej belki co w I serii wystartowano Tamiego Kiuru, który uzyskał 116,5 metra. Ten wynik pozwolił Finowi wyprzedzić kilku swoich kolegów, lepszych w pierwszym skoku. O dwa metry krócej skoczył Bjoern Einar Romoeren (114,0 m), ale mimo tego nie dał się pokonać Tamiemu Kiuru. Podobnie Anders Bardal. Drugi z Norwegów uzyskał (114,5 m) i wyprzedził resztę stawki.
Pierwszym zawodnikiem w drugiej serii, który przeskoczył punkt K był reprezentant gospodarzy, Akira Higashi. 31-letni Japończyk wylądował na 121,5 metra. Niestety poziomem nie dorównali mu Marcin Bachleda (107,0 m) i Kazuyoshi Funaki (77,0 m). Znany Japończyk oddał fatalny skok i zajął ostatnie punktowane miejsce w dzisiejszym konkursie.
Powoli do formy wraca dwukrotny złoty medalista olimpijski - Simon Ammann. Szwajcar w drugiej próbie uzyskał 121 metrów i awansował do pierwszej dziesiątki konkursu. Wyprzedził m.in.: Pettersena i Liegla (obaj po 114 m). Rewelacyjną, 11 pozycję po I serii zajmował Dmitri Vassiliev. Rosjanin w drugim skoku doleciał na 109 metr i także nie pokonał Ammanna. Dokonał tego dopiero Roar Ljoekelsoey (121,0 m). Po Norwegu skakał Adam Małysz. Polak uzyskał 123,5 m, co tylko na chwilę dało mu prowadzenie. W tym samym miejscu wylądował Miyahira i to on wyprzedził naszego rodaka. Mimo wszystko jednak Adam awansował ostatecznie na 5 miejsce w dzisiejszym konkursie. Gorzej spisali się bowiem Widhoelzl, Kasai i Janne Ahonen. Lider Pucharu Świata uzyskał 118,5 m i uplasował się tuż za Polakiem. Po raz pierwszy w tym sezonie dwa dobre skoki oddał Matti Hautamaeki, który podobnie jak Ammann wraca do znakomitej dyspozycji sprzed roku. Fin uzyskał 122,5 metra i zajął 2 stopień podium w Hakubie. Słabszy od niego okazał się 2 po pierwszej serii, Reinhard Schwarzenberger (120,0 m). Fina pokonał tylko 18-letni Christian Nagiller, mimo, że uzyskał 122 m, wygrał konkurs PŚ przewagą z pierwszego skoku.