Andrzej Zapotoczny zaczął skakać w wieku 6 lat. Najpierw zachęcony przez ojca i brata, którzy byli kombinatorami norweskimi, uprawiał tę dyscyplinę. Potem został tylko przy skokach. Młody zawodnik zimą 2007 roku dostał szansę udziału w konkursach rangi Fis Cup. Do pierwszej dziesiątki w tego typu zawodach wskoczył w lutym 2008 roku (9 miejsce w Szczyrku). W PK Zapotoczny zadebiutował w fińskim Rovaniemi zajmując odległą, 47-mą lokatę. Później było już lepiej. Pierwsze punkty CoC młody skoczek zapisał na swoim koncie podczas występów w Vikersund. W sezonie 2008/2009, Andrzej zajął miejsce w czołowej dziesiątce w japońskim Sapporo- był dziewiąty. To najwyższa jak dotąd lokata skoczka w CoC. Mieszkaniec Białego Dunajca wystąpił także w Mistrzostwach Świata Juniorów rozgrywanych w 2009 roku w Szczyrbskim Plesie. Dużym sukcesem było trzecie miejsce zajęte przez Polaków w drużynie. Zakończył karierę.